本所設主任、稽核2人，下設6個股，6位股長。各股主要業務如下： 
 
營所遺贈稅股主要業務： 營利事業所得稅、遺產及贈與稅。
 
綜所稅徵收股主要業務： 綜合所得稅稽徵。
 
綜所稅資料股主要業務： 執行業務查核、扣繳資料稽徵。
 
銷售稅審查股主要業務： 營業稅。
 
銷售稅稽查股主要業務： 營業稅專案查核、貨物稅、菸酒稅、特種貨物及勞務稅。
 
服務管理股主要業務： 為民服務、租稅教育及宣導、欠稅執行稅捐保全、人事總務出納、政風宣導。