辦公時間：星期一至星期五（例假日休息）上午8時至12時、下午1時至5時
1樓全功能櫃檯：上午8時至下午5時 (中午不休息)
服務地區：玉里鎮、瑞穗鄉、卓溪鄉及富里鄉
服務電話：03-8881070
免費服務電話：0800-000321
本所以業務分組，下設二股，執掌業務內容：
| 職掌業務內容 | 分機 | ||
| 一、營所遺贈稅及綜所稅股 | 營利事業所得稅業務 | 203 | |
| 遺產及贈與稅業務 | 102 | ||
| 綜合所得稅服務區 |
玉里鎮 卓溪鄉 |
208 | |
| 瑞穗鄉 富里鄉 |
207 | ||
| 全功能服務櫃台 | 207 | ||
| 外僑綜合綜合所得稅業務 | 202 | ||
| 扣繳資料管理 | 203 | ||
| 非扣繳資料管理 | 202 | ||
| 執行業務及其他所得業務 | 202 | ||
| 房地合一業務 | 202 | ||
| 二、銷售稅及服務管理股 | 營業稅服務區 |
玉里鎮 卓溪鄉 |
305 |
| 瑞穗鄉 富里鄉 |
307 | ||
| 貨物稅及菸酒稅業務 | 307 | ||
| 納稅者權利保護服務、為民服務、租稅教育及宣導業務 | 206 | ||
| 欠稅清理、出納業務 | 501 | ||
| 文書檔案管理 | 501 | ||
| 設備管理 | 307 | ||
| 人事庶務、兼辦主計業務 | 502 | ||
| 兼辦政風 | 201 | ||
| 總收發櫃台 | 505 | ||